自前のCSSを使っている場合、TinyMCEにもそのCSSを当てて、WYSIWYGにすることが多いと思います。
その際、
ツール ＞ グローバル設定 ＞ インターフェースとその他の機能
「CSSファイルへのパス」で設定しますが、
MODx日本語版（1.0.4J-r1）について（おそらく以前のバージョンから）、
注釈には絶対パスで指定する例が記載されていますが、
実際には、MODxのルートからの相対パスを設定する必要があります。
例えば「http://www.hogehoge.net/css/mycss.css」を使用したい場合、
「/css/mycss.css」ではなく「css/mycss.css」を設定する必要があります。